Amnesiac è stato registrato nelle stesse sessioni di Kid A e questo ha portato qualcuno a considerare l'album come un "B-sides" di Kid A, ma la band sostiene che i due lavori devono essere considerati in maniera separata. Inizialmente la critica trova l'album meno coeso a confronto di Kid A, per poi accordare che questa mancanza di continuità è un modo per differenziare i due album. Thom Yorke spiega così la cosa: "Sono separati perché non possono essere presi uno dopo l'altro come in una linea retta. Si cancellano l'un l'altro come lavori completi. Credo che Amnesiac dia un'altra interpretazione di Kid A, è una specie di spiegazione. Torna ad ascoltare Kid A dopo Amnesiac, e credo che si capirà". Sulle differenze fra i due: "Kid A era come uno shock elettrico. Amnesiac è come essere nei boschi, in campagna. Forse l’Artwork è il modo migliore per spiegarlo. In Kid A era tutto sviluppato sulla distanza. I fuochi erano tutti dall'altra parte della collina. In Amnesiac, tu sei nella foresta mentre divampa il fuoco". Esiste un'edizione speciale dell'album che è un libro a copertina rigida con il CD inserito nella seconda di copertina. Il libro s’ispira a quelli della "Catachresis College Library" completo di date stampate, e contiene molte pagine artistiche disegnate da Stanley Donwood e Thom Yorke, che si è firmato con lo pseudonimo di "Tchocky"